В статье описан подход к организации процесса извлечения информации из протоколов клинических испытаний под управлением онтологии. Рассмотрены отдельные компоненты модели знаний, включая семантический словарь, жанровую модель текста, онтологию клинических испытаний, и приведены примеры ситуаций.